安装
依赖
如果想使用 C 程序 grt ,
FFTW ,其静态库已链接到预构建版本
NetCDF ,其静态库已链接到预构建版本
Seismic Analysis Code (SAC) ,需在对应网址申请下载。 用于用户进一步处理 SAC 格式的输出波形。
如果你想以Python脚本形式使用,依赖已在 setup.py 中写好,直接使用 pip 安装即可。
安装预构建版本
目前 PyGRT 已分发内置预构建二进制文件的安装包,用户仅需运行以下命令即可(建议使用 Anaconda 虚拟环境)
pip install pygrt-kit
或者从 Github Releases 中下载最新版本的程序压缩包(符合自己的操作系统),解压,在根目录下运行以下命令即可
pip install .
如果你不想使用Python,只想使用传统的命令行形式运行C程序,也可从 Github Releases 中下载最新版本的程序压缩包(符合自己的操作系统), 解压,其中
pygrt/C_extension/bin和pygrt/C_extension/lib为预构建好的可执行文件目录和动态/静态库目录, 按自己习惯配置环境变量PATH即可(详见下方)。
环境变量配置
如果你使用 pip 安装后,想使用构建好的C程序 grt ,需配置环境变量
PATH。运行以下命令python -m pygrt.print
输出
PyGRT installation directory: </path/to/installation> PyGRT executable file directory: </path/to/installation/bin> PyGRT library directory: </path/to/installation/lib>
将其中的 “PyGRT executable file directory” 路径添加到环境变量
PATH中即可。如果是从 Github Releases 上直接下载的压缩包,则只需将解压后的
bin/路径添加到环境变量PATH中即可。
C程序 grt 的运行独立于Python,每个C程序可使用 -h 查看帮助。
从源码构建安装
如果安装好预构建版本后,运行 C 或 Python 提示 “GLIBC” 版本缺失以及其它库的版本问题,可尝试从源码从头构建二进制库文件和可执行文件。
要求安装双精度和单精度两个版本,且要求编译出静态库,并要求在环境变量
LIBRARY_PATH中配置静态库路径。如果从源码编译安装 FFTW ,通常在其目录下运行以下命令即可安装+配置路径成功(以 Ubuntu 系统为例):# 编译双精度版本 ./configure CFLAGS="-fPIC" make make install # 编译单精度版本 ./configure CFLAGS="-fPIC" --enable-float make make install
构建 PyGRT 。
切换到 PyGRT 程序目录(不论是使用 pip 安装的还是从 Github Releases 下载的),切换到
pygrt/C_extension,运行make进行构建。成功后会在
bin/和lib/路径下看到新构建出来的可执行文件和库文件。如果正确配置了PATH可尝试运行 grt -h 看能否正常打印帮助文档。再运行make cleanbuild可清理构建过程产生的中间文件夹
build/。
常见问题
如果运行报错,提示缺少依赖(常见于MacOS),这通常是缺少
OpenMP库。尝试安装 gcc 编译器,其中会自带OpenMP。“GLIBC” 版本缺失:请尝试从源码构建。